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Neuromuscular                   Traduzione di Natale Marzari

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Neuromuscular               Traduzione del 28 giugno 2021


 

Giunzioni del mRNA

Disturbi
Generale
Spliceosomi


Giunzione pre-mRNA

  • Struttura del gene DNA 
    • Esoni
      • Gli esoni interni hanno in media una lunghezza di 145 nucleotidi 
      • Contengono anche elementi regolatori 
        • Necessaria per una efficiente giunzione di esoni costitutivi e alternativi
        • Diversi corredi di elementi regolatori e ausiliari usati da diversi geni
        • Tipi
          • ESE: Incrementatori di giunzioni esoniche
          • ESS: Silenziatori di giunzioni esoniche
    • Introni
      • Lunghi in media più di 10 volte degli esoni
      • Contengono anche elementi regolatori 
        • Modulano l'uso specifico per le cellule degli esoni alternativi
        • Agisce da legante per i complessi regolatori multicomponenti
        • Tipi
          • ISEs: Incrementatori di giunzioni introniche
          • ISSs: Silenziatori di giunzioni introniche
    • Giunzione siti
      • Localizzazione: At Introne/esone borders
      • Tipi
        • Sito di giunzione 5'
          • Sequenza: AGguragu
          • U1 snRNP: Si lega al sito di giunzione 5'
        • Sito di giunzione 3'
          • Sequenza: yyyyyyy nagG (y= pirimidina)
        • Sito di ramificazione
          • Sequenza: ynyuray (r = purine)
          • U2 snRNP: Si lega al sito di ramificazione via RNA: Interazioni RNA fra snRNA e pre-mRNA
      • Struttura: Breve; Contengono sequenze tipiche "degenerate"
  • Funzioni generali della giunzione pre-mRNA 
    • Rimozione degli introni
    • Giunzioni alternative
      • Definizione: Unione di differenti siti di giunzione da 5' e 3'
      • Caratteristiche generali
        • ~80% di giunzioni alternative comporta cambiamenti nella proteina codificata
        • Fino al 59% dei geni umani esprime più di un mRNA mediante giunzioni alternative
      • Effetti funzionali: Genera forme diverse di mRNA dal un singolo gene
        • Consente di esprimere isoforme proteiche funzionalmente diverse in base a diversi programmi regolativi
        • Effetti strutturali: Inserire o rimuovere aminoacidi; Spostamenti nella sequenza di lettura; Introdurre il codone di terminazione
        • Effetti dell'espressione genica: Rimuove o inserisce elementi regolatori controllanti la traslazione, la stabilità o la localizzazione del mRNA
      • Regolazione
        • Specifica per la cellula
        • Percorsi di giunzione modulati in base a: Tipo di cellula; Fase di sviluppo; Genere; Stimoli esterni

Spliceosomi 1

Spliceosoma: generale
  • Posizione: Nucleo
  • Funzione
    • Processare il pre-mRNA congiungente gli acidi nucleici intronici
    • Produrre lo mRNA che viene poi tradotto in proteine nei ribosomi
  • Meccanismi di azione
    • Riconoscimento dei confini introne/esone
      • Tramite le sequenze di splice e molteplici altri segnali deboli
    • Catalisi delle reazioni taglia e incolla che rimuovono gli introni
      e uniscono gli esoni
  • Contenuto
Componenti delle snRNP  
  • Omonimo allo snRNA (Per es. U1 snRNP ha U1 snRNA)
    • Agli snRNP RNA: U1 ; U2 ; U4; U5; U6
    • Differisce dagli mRNA nella struttura del cappuccio: 2,2,7-trimetil guanosina
  • Proteine nucleari "Smith" (SM) comune a tutti gli snRNP
    • B e B' , D1 , D2 , D3 , E , F, G
    • Legano la sequenza AU4-6G
    • Legano prima allo snRNA 
    • Obiettivi degli autoanticorpi (anti-Sm) nel lupus sistemico  
      • Principali obiettivi: Proteine Sm-B/B' e D
      • Gli anticorpi precipitano le particelle U1, U2, U4/U6 e U5 
  • Proteine specifiche degli snRNP
    • U1: 70k , A , C
      • Bersaglio selettivo degli autoanticorpi (anti-nRNP)
        • Nella malattia del tessuto connettivo misto
      • Bersaglio proteico di solito U1-70k o U1A
    • U2: A' , B''
    • U5: 25K, 1BP
  • Specifica del cervello: SNRNP-N
  • Altro
Ruoli funzionali per ogni snRNP
  • U1
    • Lega inizialmente al sito di giunzione 5'
    • Rilasciata al reclutamento di U4/U5/U6
      • ? Determina quale sito di giunzione 5' viene utilizzato
  • U2
    • Inizialmente si lega alla sequenza di riconoscimento del punto di ramificazione
    • Forma due doppiette con U6
      • Porta l'introne al sito di giunzione 5' precisamente al punto di ramificazione
  • U4
    • Inizialmente complessata con U5 e U6
    • Mantiene U6 in una conformazione non ripiegata 
    • Rilasciata dopo aver consegnato U6 al sito di giunzione 5'
      • ? chaperone di U6
  • U5
    • Inizialmente complessata con U4 e U6
    • Si lega alle sequenze dell'esone
      • Posizione
        • A monte del sito di giunzione 5'
        • A valle del sito di giunzione 3'
      • ? Guida la sequenza per tenere insieme gli esoni
  • U6
    • Inizialmente complessata con U4 e U5
    • Distacca U1 dal sito di giunzione 5'
    • Forme doppietta con le sequenze dell'introne
    • Complessa con U2
      • Porta l'introne al sito di giunzione 5' precisamente al punto di ramificazione
      • ? Attività catalitica
Spliceosomi: Illustrazioni

Giunzione Pre-mRNA






U1 Si lega al sito di giunzione 5'




U2 Si lega alls sequenza di riconoscimento
 del punto di ramificazione





Il complesso U4-U5-U6
Si lega al sito di giunzione 5'




 
U1 viene spostato
U6 si lega a U2 al sito di giunzione 5'
vicino punto di ramificazione





 
U5 Si lega alle sequenze dell'esone
L'introne viene rimosso



   


Giunzione pre-mRNA: Disturbi umani 2

Effetti della mutazione: Principi generali
  • Tipi di distruzioni dell'elemento di giunzione
    • Elemento cis
      • Colpisce l'espressione di un singolo gene
      • Può colpire l'uso di siti di giunzione costitutivi o alternativi
      • Distrugge le giunzioni costruttive : Più frequentemente produce la perdita di espressione del gene dovuta a giunzione aberrante
      • Inattivazione o attivazione dell'uso dei siti di giunzione alternativi 
        • Può forzare l'espressione di un modello di giunzione alternativo: Viene espresso lo mRNA naturale
        • Ma l'espressione in un tessuto o stadio di sviluppo inappropriati potrebbe produrre una malattia
    • Effetto trans  
  • Tipi di mRNA prodotti
    • Espressione di mRNA innaturali: La giunzione aberrante crea modelli di giunzione innaturali
    • L'inappropriata espressione di mRNA naturali: Distrugge l'uso dei siti di giunzione alternativi
Effetti della mutazione: Disturbi
  • Effetti cis : Mutazioni che distruggono l'uso dei siti di giunzione alternativi
    • Carenza famigliare isolata dell'ormone della crescita di tipo II: Bassa statura  
      • La mutazioni causa un aumento delle giunzioni alternative dell'esone 3
      • Meccanismo: Distruzione di uno dei tre elementi di giunzione, ISE, ESE, o del sito di giunzione 5'  
    • Sindrome di Frasier: Le mutazioni inattivano il sito di giunzione 5', producendo una deriva delle isoforme
    • Demenza frontotemporale e parkinsonismo collegati al cromosoma 17 (FTDP-17)
      • Meccanismo: La maggior parte delle mutazioni altera gli elementi regolatori; Causando la malattia da aumentando l'inclusione dell'esone 10 del gene MAPT
    • Fibrosi cistica atipica  
      • I polimorfismi nell'introne 8 colpiscono la giunzione dell'esone 9: Manifestazioni variabili della malattia
  • Effetti trans: Mutazioni che colpiscono il meccanismo basale della giunzione  
    • Retinite pigmentosa
      • Sindromi RP dominanti: PRPF31; HPRP3; PRPC8
      • Geni coinvolti nella funzione di U4/U6 · U5 tri-snRNP
    • Atrofia muscolare spinale
      • Il gene SMN2 non compensa completamente la perdita della funzione SMN1  
        • Una sostituzione di un nucleotide distrugge un ESE nell'esone 7: Causando lo spostamento dell'esone 7 nella maggior parte degli mRNA SMN2
      • SMN1 è un assemblatore dei complessi SnRNP  
        • U1, U2, U4, e U5 snRNP
        • SMN è necessario per l'assemblaggio citoplasmatico degli snRNP
  • Effetti trans: Mutazioni che colpiscono i regolatori delle giunzioni alternativ
    • Distrofia miotonica: DM1; DM2
      • Gli RNA con lunghe tracce di  ripetizioni CUG o CCUG sono trascritti dagli alleli espansi  DMPK e ZNF9
      • Gli RNA contenenti ripetizioni si accumulano in focolai nucleari discreti
      • Le ripetizioni RNA espanse: Distruggono la funzione delle proteine leganti agli RNA  
        • CUG-BP: Possono essere associate con la distruzione del processamento RNA dei cTNT, IR e ClC-1
        • Legami muscolari: Associati con focolaii nucleari
      • I 5 pre-mRNA sottostanno ad uno splicing regolato aberrantemente nel DM1: Commutandoli ad un modello embrionico  
        • Troponina cardiaca T (cTNT): ? Correlata alla malattia cardiaca
        • Recettore dell'insulina (IR): Isoforma a basso livello di segnalazione; Correlato con la resistenza all'insulina nella DM
        • Canale del cloro specifico muscolare (ClC-1): Perdita della funzione; Probabilmente correlata alla miotonia nella DM
        • Tau
        • Correlati alla miotubularina 1
    • Neoplasie
  • Disturbi delle proteine RNP  
  • Altri disturbi dell'elaborazione dell'RNA  

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Riferimenti
1. Clin Exp Rheum 1997;15:549-560
2. geni e Devel 2003;17:419–437

5/18/2020

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